Badan Perencanaan Penelitian, dan Pengembangan (BAPELITBANG) merupakan unsur penunjang urusan pemerintahan yang melaksanakan fungsi penunjang perencanaan dan penunjang penelitian dan pengembangan. Bapelitbang dipimpin oleh Kepala Badan yang berkedudukan di bawah dan bertanggung jawab kepada Bupati melalui Sekretaris Daerah. Badan Perencanaan Penelitian, dan Pengembangan (BAPELITBANG) Daerah Kabupaten Kepulauan Aru mempunyai tugas melaksanakan penyusunan dan pelaksanaan kebijakan daerah di bidang perencanaan pembangunan daerah.